Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1O70583 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1O70583 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mid1O70583 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms