Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lnx1O70263 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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