Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rad51dO55230 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad51dO55230 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rad51dO55230 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rad51dO55230 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rad51dO55230 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rad51dO55230 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad51dO55230 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rad51dO55230 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms