Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnk2O54967 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms