Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek2O35942 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek2O35942 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms