Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pik3cdO35904 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pik3cdO35904 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms