Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops5O35864 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops5O35864 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops5O35864 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops5O35864 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms