Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tnfrsf18O35714 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms