Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk3O35492 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk3O35492 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk3O35492 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk3O35492 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk3O35492 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk3O35492 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk3O35492 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms