Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sema6aO35464 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema6aO35464 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms