Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-ObO35424 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-ObO35424 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms