Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcc1O35379 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms