Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn1O35350 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn1O35350 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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