Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd2O35245 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms