Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe40O35185 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms