Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scarb2O35114 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms