Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sypl1O09117 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sypl1O09117 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms