Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfil3O08750 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfil3O08750 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfil3O08750 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfil3O08750 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nfil3O08750 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nfil3O08750 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nfil3O08750 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms