Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp35M0QWN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp35M0QWN7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp35M0QWN7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp35M0QWN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp35M0QWN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Usp35M0QWN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp35M0QWN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp35M0QWN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp35M0QWN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp35M0QWN7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp35M0QWN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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