Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4b4J3QNS5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms