Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17577J3QNF7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms