Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc180J3QNE4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc180J3QNE4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms