Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20918J3QN17 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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