Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn34c3J3QJW5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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