Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arfip1G5E8V9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms