Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tubgcp6G5E8P0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms