Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Colca2F8VPY8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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