Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5160F8VPN3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms