Protein–RNA interactions for Protein: F7AEC7

Gm2832, Predicted gene 2832 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2832F7AEC7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2832F7AEC7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2832F7AEC7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms