Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5861F6VCN9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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