Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pagr1bF6V0H0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms