Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngap1F6SEU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngap1F6SEU4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms