Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf4E9QAP7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf4E9QAP7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms