Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Urb2E9Q7L1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Urb2E9Q7L1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms