Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DspE9Q557 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DspE9Q557 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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