Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip11E9Q512 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms