Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Pde8bE9Q4S1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde8bE9Q4S1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms