Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms