Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdr1E9Q0B4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdr1E9Q0B4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms