Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd1E9PZ26 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd1E9PZ26 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms