Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srp54bE9PXC0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms