Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trappc8E9PWG2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms