Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clca3bE9PUL3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms