Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Soga1E1U8D0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Soga1E1U8D0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms