Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rdh8D3Z6W3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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