Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim12cD3Z3L3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms