Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms