Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd1D3YXK1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd1D3YXK1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms