Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms