Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam71aB7XG49 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam71aB7XG49 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms